MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Chloracidobacterium thermophilum B chromosome chromosome 1

Total Repeats: 53773

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016024	ATG	2	6	1	6	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347753733
2	NC_016024	GAC	2	6	7	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753733
3	NC_016024	TGCC	2	8	99	106	0 %	25 %	25 %	50 %	347753733
4	NC_016024	GAA	2	6	184	189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347753733
5	NC_016024	GC	3	6	217	222	0 %	0 %	50 %	50 %	347753733
6	NC_016024	GGCG	2	8	351	358	0 %	0 %	75 %	25 %	347753733
7	NC_016024	TTG	2	6	365	370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347753733
8	NC_016024	TGT	2	6	423	428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347753733
9	NC_016024	GC	4	8	448	455	0 %	0 %	50 %	50 %	347753733
10	NC_016024	GGC	2	6	514	519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753733
11	NC_016024	GAAC	2	8	621	628	50 %	0 %	25 %	25 %	347753733
12	NC_016024	TCA	2	6	629	634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347753733
13	NC_016024	TGC	2	6	692	697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753733
14	NC_016024	TTC	2	6	748	753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347753733
15	NC_016024	CAC	2	6	812	817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347753733
16	NC_016024	GGA	2	6	834	839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347753733
17	NC_016024	GCC	2	6	885	890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753733
18	NC_016024	A	6	6	938	943	100 %	0 %	0 %	0 %	347753733
19	NC_016024	TGG	2	6	1028	1033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347753733
20	NC_016024	CTCA	2	8	1041	1048	25 %	25 %	0 %	50 %	347753733
21	NC_016024	AGC	2	6	1049	1054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753733
22	NC_016024	GAA	3	9	1099	1107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347753733
23	NC_016024	GTC	2	6	1138	1143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753733
24	NC_016024	AAC	2	6	1186	1191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347753733
25	NC_016024	AGC	2	6	1238	1243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753733
26	NC_016024	ACCA	2	8	1246	1253	50 %	0 %	0 %	50 %	347753733
27	NC_016024	GCCT	2	8	1256	1263	0 %	25 %	25 %	50 %	347753733
28	NC_016024	CAA	2	6	1284	1289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347753733
29	NC_016024	TCA	2	6	1364	1369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347753733
30	NC_016024	GCC	2	6	1691	1696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753734
31	NC_016024	GCA	2	6	1749	1754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753734
32	NC_016024	CTG	2	6	1756	1761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753734
33	NC_016024	CAC	2	6	1766	1771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347753734
34	NC_016024	GCC	2	6	1861	1866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753734
35	NC_016024	GGT	2	6	1986	1991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347753734
36	NC_016024	GC	3	6	1993	1998	0 %	0 %	50 %	50 %	347753734
37	NC_016024	ATG	2	6	2009	2014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347753734
38	NC_016024	TGGA	2	8	2026	2033	25 %	25 %	50 %	0 %	347753734
39	NC_016024	TG	4	8	2086	2093	0 %	50 %	50 %	0 %	347753734
40	NC_016024	GCA	2	6	2115	2120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753734
41	NC_016024	GTG	2	6	2212	2217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347753734
42	NC_016024	CGG	2	6	2243	2248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753734
43	NC_016024	GA	3	6	2255	2260	50 %	0 %	50 %	0 %	347753734
44	NC_016024	TGA	2	6	2334	2339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347753734
45	NC_016024	CAG	2	6	2410	2415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753734
46	NC_016024	GCC	2	6	2419	2424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753734
47	NC_016024	GAT	2	6	2431	2436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347753734
48	NC_016024	CGG	2	6	2501	2506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753734
49	NC_016024	CTT	2	6	2563	2568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347753734
50	NC_016024	GT	3	6	2596	2601	0 %	50 %	50 %	0 %	347753734
51	NC_016024	CGA	2	6	2646	2651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753734
52	NC_016024	CCT	2	6	2670	2675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347753734
53	NC_016024	GGT	2	6	2716	2721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347753734
54	NC_016024	GC	3	6	2738	2743	0 %	0 %	50 %	50 %	347753734
55	NC_016024	CCGT	2	8	2828	2835	0 %	25 %	25 %	50 %	347753734
56	NC_016024	ATG	2	6	2870	2875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347753734
57	NC_016024	TCG	2	6	3030	3035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753734
58	NC_016024	CCA	2	6	3036	3041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347753734
59	NC_016024	CGT	2	6	3057	3062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753734
60	NC_016024	ACG	2	6	3085	3090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753734
61	NC_016024	T	6	6	3114	3119	0 %	100 %	0 %	0 %	347753734
62	NC_016024	GGT	2	6	3129	3134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347753734
63	NC_016024	CGG	2	6	3150	3155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753734
64	NC_016024	ATG	2	6	3221	3226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347753734
65	NC_016024	CGC	2	6	3256	3261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753734
66	NC_016024	AGG	2	6	3333	3338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347753734
67	NC_016024	GTCA	2	8	3702	3709	25 %	25 %	25 %	25 %	347753735
68	NC_016024	GCC	2	6	3789	3794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753735
69	NC_016024	CGC	2	6	3819	3824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753735
70	NC_016024	GCC	2	6	3828	3833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753735
71	NC_016024	CCAT	2	8	3841	3848	25 %	25 %	0 %	50 %	347753735
72	NC_016024	CAT	3	9	3905	3913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347753735
73	NC_016024	GCT	2	6	3916	3921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753735
74	NC_016024	ACGG	2	8	3983	3990	25 %	0 %	50 %	25 %	347753735
75	NC_016024	GCG	2	6	4087	4092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753735
76	NC_016024	GGC	2	6	4100	4105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753735
77	NC_016024	TCA	2	6	4144	4149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347753735
78	NC_016024	CTG	2	6	4162	4167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753735
79	NC_016024	TCG	2	6	4300	4305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753735
80	NC_016024	GCG	2	6	4306	4311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753735
81	NC_016024	TCA	2	6	4333	4338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347753735
82	NC_016024	TCG	2	6	4342	4347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753735
83	NC_016024	AGT	2	6	4348	4353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347753735
84	NC_016024	CTT	2	6	4563	4568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347753736
85	NC_016024	ATT	2	6	4662	4667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347753736
86	NC_016024	TTA	2	6	4679	4684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347753736
87	NC_016024	CGG	2	6	4723	4728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753736
88	NC_016024	GAA	2	6	4803	4808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347753736
89	NC_016024	CGG	2	6	4852	4857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753736
90	NC_016024	CAT	2	6	4934	4939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347753736
91	NC_016024	TGG	2	6	4957	4962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347753736
92	NC_016024	CAT	3	9	4964	4972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347753736
93	NC_016024	CGCC	2	8	4973	4980	0 %	0 %	25 %	75 %	347753736
94	NC_016024	CTG	2	6	5067	5072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753736
95	NC_016024	TTG	2	6	5089	5094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347753736
96	NC_016024	GCG	2	6	5201	5206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753736
97	NC_016024	GAA	2	6	5219	5224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347753736
98	NC_016024	GGCA	2	8	5279	5286	25 %	0 %	50 %	25 %	347753736
99	NC_016024	GCC	2	6	5346	5351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753736
100	NC_016024	AT	3	6	5360	5365	50 %	50 %	0 %	0 %	347753736
101	NC_016024	CGG	2	6	5374	5379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753736
102	NC_016024	GTCGC	2	10	5383	5392	0 %	20 %	40 %	40 %	347753736
103	NC_016024	AGCC	2	8	5402	5409	25 %	0 %	25 %	50 %	347753736
104	NC_016024	CTA	2	6	5414	5419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347753736
105	NC_016024	ATT	2	6	5457	5462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347753736
106	NC_016024	CCA	2	6	5491	5496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347753736
107	NC_016024	GTG	2	6	5558	5563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347753737
108	NC_016024	ATT	2	6	5564	5569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347753737
109	NC_016024	GC	3	6	5667	5672	0 %	0 %	50 %	50 %	347753737
110	NC_016024	CA	3	6	5748	5753	50 %	0 %	0 %	50 %	347753737
111	NC_016024	TCC	2	6	6031	6036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347753738
112	NC_016024	CGC	2	6	6111	6116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753738
113	NC_016024	G	6	6	6167	6172	0 %	0 %	100 %	0 %	347753738
114	NC_016024	GCT	2	6	6180	6185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753738
115	NC_016024	CTT	2	6	6192	6197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347753738
116	NC_016024	CAG	2	6	6214	6219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753738
117	NC_016024	CAG	2	6	6229	6234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753738
118	NC_016024	AGAA	2	8	6278	6285	75 %	0 %	25 %	0 %	347753738
119	NC_016024	TGGC	2	8	6452	6459	0 %	25 %	50 %	25 %	347753738
120	NC_016024	CGC	2	6	6476	6481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753738
121	NC_016024	CAAG	2	8	6548	6555	50 %	0 %	25 %	25 %	347753738
122	NC_016024	ACAG	2	8	6567	6574	50 %	0 %	25 %	25 %	347753738
123	NC_016024	TGA	2	6	6687	6692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347753738
124	NC_016024	TTG	2	6	6734	6739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347753738
125	NC_016024	ACCC	2	8	6744	6751	25 %	0 %	0 %	75 %	347753738
126	NC_016024	CAT	2	6	6767	6772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347753738
127	NC_016024	CGG	2	6	6800	6805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753738
128	NC_016024	ACC	2	6	6813	6818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347753738
129	NC_016024	CGT	2	6	6873	6878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753738
130	NC_016024	TGA	2	6	6885	6890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347753738
131	NC_016024	AC	3	6	7025	7030	50 %	0 %	0 %	50 %	347753738
132	NC_016024	CAG	2	6	7124	7129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753739
133	NC_016024	CGG	2	6	7220	7225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753739
134	NC_016024	TTCC	2	8	7336	7343	0 %	50 %	0 %	50 %	347753739
135	NC_016024	GTA	2	6	7469	7474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347753739
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249	NC_016024	GC	3	6	12969	12974	0 %	0 %	50 %	50 %	347753744
250	NC_016024	AAGG	2	8	13095	13102	50 %	0 %	50 %	0 %	347753744
251	NC_016024	TGCCGC	2	12	13103	13114	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	347753744
252	NC_016024	CCACG	2	10	13148	13157	20 %	0 %	20 %	60 %	347753744
253	NC_016024	CGG	2	6	13163	13168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753744
254	NC_016024	CGG	2	6	13198	13203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753744
255	NC_016024	CG	3	6	13218	13223	0 %	0 %	50 %	50 %	347753744
256	NC_016024	CGA	2	6	13265	13270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753744
257	NC_016024	GCCG	2	8	13401	13408	0 %	0 %	50 %	50 %	347753745
258	NC_016024	GC	3	6	13410	13415	0 %	0 %	50 %	50 %	347753745
259	NC_016024	GCC	2	6	13491	13496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753745
260	NC_016024	CGG	2	6	13502	13507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753745
261	NC_016024	GAT	2	6	13518	13523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347753745
262	NC_016024	CG	3	6	13794	13799	0 %	0 %	50 %	50 %	347753745
263	NC_016024	GCCG	2	8	13893	13900	0 %	0 %	50 %	50 %	347753745
264	NC_016024	CCG	2	6	13903	13908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753745
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381	NC_016024	CCAGGC	2	12	19949	19960	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	347753751
382	NC_016024	CGC	2	6	19973	19978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753751
383	NC_016024	TGA	2	6	19994	19999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347753751
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385	NC_016024	TGC	2	6	20070	20075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753751
386	NC_016024	AGC	2	6	20098	20103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753751
387	NC_016024	CAGA	2	8	20122	20129	50 %	0 %	25 %	25 %	347753751
388	NC_016024	GCA	2	6	20159	20164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753751
389	NC_016024	GGC	2	6	20309	20314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753751
390	NC_016024	TCA	2	6	20315	20320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347753751
391	NC_016024	GAT	2	6	20343	20348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347753751
392	NC_016024	AGC	2	6	20371	20376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753751
393	NC_016024	CAG	2	6	20420	20425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753751
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395	NC_016024	CGG	2	6	20496	20501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753751
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400	NC_016024	GAT	2	6	20682	20687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347753751
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425	NC_016024	AC	3	6	21802	21807	50 %	0 %	0 %	50 %	347753752
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